Dostępne tematy badawcze:
Nawigacja okruszkowa
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Nawigacja
Widok zawartości stron
M3. Mechanism of action of stem cell-specific lncRNAs at molecular and cellular levels (dr hab. Przemysław Grudnik & dr Marta Pabiś)
Supervisors:
dr hab. Przemysław Grudnik
dr Marta Pabiś (project leader)
Malopolska Centre of Biotechnology (MCB)
Project description:
The project is designed to uncover the mechanism of action of selected human pluripotent stem cell (PSC)-specific lncRNAs. Although over 170 000 human lncRNAs transcripts are reported in most recent releases of databases (e.g. NONCODE), only a part of those RNAs have been attributed a biological function based on specific experimental studies reported in literature. Moreover, their interaction with binding partners (e.g. proteins) and mechanisms of action underlying their cellular functions are still far from being well understood. There is also a shortage of experimental data concerning lncRNA structure. The PhD student will apply structural biology and biochemical approaches to address these unknowns and work in close collaboration with the Postdoctoral researcher who will focus on lncRNA mechanisms of action on the cellular level. The planned scope of the PhD student work is the following:
- Determination of two-dimensional structures and identification of structural modules of the selected lncRNAs using bioinformatic and chemical probing approaches
- Confirmation of direct interactions with protein binding partners reported in literature and identified within our studies, as well as their biochemical characterization in vitro
- Identification of the localization of protein binding sites on the lncRNAs, both in vitro and in cells (the later in collaboration with the Postdoctoral researcher)
- Three-dimensional structural analysis of largest stable fragments of studied lncRNAs with and without protein-binding partners by cryo-EM and crystallography
- Validation of structural data in cells (in collaboration with the Postdoctoral researcher)
Candidate profile:
- MSc or equivalent degree in biology, biotechnology, chemistry or other relevant field
- Interest in RNA biology and structural biology
- Basic experience in molecular biology and biochemistry
- Previous experience in structural biology techniques is not required but is a plus
- Very good knowledge of English (written and spoken)
- Very good presentation and communication skills
- High motivation and engagement in research work, reasonable level of independence at work, positive attitude, good organizational skills, ability of multitasking
Widok zawartości stron
Nauki Biomedyczne
Komunikat Dyrektora SDNŚiP z dnia 30.04.2024
o rekrutacji na program kształcenia (PK) Nauki Biomedyczne
w Szkole Doktorskiej Nauk Ścisłych i Przyrodniczych
na rok 2024/25
język kształcenia: angielski
Nauki Biomedyczne to program kształcenia o silnym interdyscyplinarnym, międzynarodowym, międzysektorowym wymiarze badawczym i szkoleniowym.
Rekrutujemy naukowców na wczesnym etapie kariery (Early Stage Researchers) w otwartym naborze, skierowanym do najbardziej utalentowanych i zmotywowanych naukowców w dziedzinie nauk biologicznych i medycznych. Proces rekrutacji będzie zgodny z wytycznymi zawartymi w kodeksie postępowania przy rekrutacji pracowników naukowych i Europejskiej Karcie Naukowca, zapewniając przejrzystość procesu rekrutacji w oparciu o zasługi i umiejętności kandydatów. Proces rekrutacji nie będzie dyskryminował kandydatów ze względu na ich cechy osobiste.
Kształcenie będzie skoncentrowane na zainteresowaniach i wiedzy specjalistycznej naukowców pracujących w jednej z trzech jednostek:
- Małopolskie Centrum Biotechnologii (MCB),
- Jagiellońskie Centrum Rozwoju Leków (JCET),
- Narodowe Centrum Promieniowania Synchrotronwoego SOLARIS.
Program obejmuje różne obszary biologii:
- syntetyczną,
- strukturalną,
- molekularną,
- komórkową,
- rozwojową
i wykorzystuje rośliny, wirusy, bakterie, bezkręgowce i kręgowce. Program jest również powiązany z interdyscyplinarnymi badaniami w biomedycynie śródbłonka.
Doktoranci, którym zaoferujemy miejsce w Szkole Doktorskiej, otrzymają pełne stypendium finansowane przez polski rząd niezależnie od narodowości.
Kandydaci są rekrutowani na konkretne tematy badawcze oferowane przez potencjalnych promotorów.
Zachęcamy naszych studentów do angażowania się w szeroki zakres działalności naukowej grup badawczych MCB, JCET i Solaris. Jest to również doskonała okazja, aby nauczyć się myśleć interdyscyplinarnie i budować nowe umiejętności.
Program prowadzony jest w języku angielskim w systemie ośmiosemestralnym.
Podczas studiów nasi studenci powinni uczestniczyć w kursach szkoleniowych w zakresie uniwersalnych i ogólnych umiejętności badawczych, uczestniczyć w działaniach studenckich i zewnętrznych, regularnie prezentować swoją pracę i uczestniczyć w seminariach.
Zobacz również:
Strona internetowa Małopolskiego Centrum Biotechnologii (MCB)
Strona internetowa Jagiellońskiego Centrum Rozwoju Leków (JCET)
Strona internetowa Narodowego Centrum Promieniowania Synchrotronowego SOLARIS
Podstrona programu Nauki biomedyczne
Widok zawartości stron
Lista dostępnych tematów badawczych:
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Zagnieżdżone portlety
Widok zawartości stron
Jak aplikować?
- Sprawdź harmonogram rekrutacji.
- Zapoznaj się z zasadami i szczegółowymi warunkami rekrutacji.
- Zbierz wymagane dokumenty.
- Zgłoś się w Systemie Internetowej Rejestracji Kandydatów (IRK).
- szczegółowa instrukcja obsługi IRK,
- zwróć uwagę: w systemie IRK rejestracja może być widoczna dopiero w momencie rozpoczęcia przyjmowania zgłoszeń
- Przystąp do egzaminu.
- Dokonaj wpisu do Szkoły Doktorskiej.
Widok zawartości stron
Harmonogram rekrutacji
dla PK Nauki Biomedyczne
I tura:
- 21 maja 2024 – Otwarcie rejestracji w IRK
- 12 czerwca 2024 – Zamknięcie rejestracji w IRK
- 2-3 lipca 2024 – Egzaminy wstępne
- 3 lipca 2024 – Posiedzenie komisji
- 8 lipca 2024 – Ogłoszenie wyników
- 22-31 lipca 2024 – Wpisy do Szkoły Doktorskiej*
- 1-2 sierpnia 2024 – Wpisy do Szkoły Doktorskiej z listy rezerwowej*
*wpisy możliwe w dniach i godzinach pracy sekretariatu PK
Widok zawartości stron
Limit miejsc
I tura:
-
w Małopolskim Centrum Biotechnologii – 3 osoby
-
w Jagiellońskim Centrum Rozwoju Leków (JCET) – 4 osoby
-
w Narodowym Centrum Promieniowania Synchrotronowego SOLARIS – 2 osoby
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Kontakt
Sekretariat Programu Kształcenia
mgr Magdalena Pisarczyk
tel.: 453 672 171
e-mail: magdalena.pisarczyk@uj.edu.pl
Kierownik Programu Kształcenia
dr hab. Piotr Rozpądek, prof. UJ
tel.: 12 664 6108
e-mail: piotr.rozpadek@uj.edu.pl
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Informacje przedstawione na tej podstronie dotyczą rekrutacji na rok akademicki 2024/25. Dokumenty takie jak: zasady rekrutacji, lista wymaganych dokumentów, program kształcenia i inne, mogą się zmienić w kolejnej rekrutacji. Większość dokumentów różni się dla poszczególnych programów kształcenia. Zawsze sprawdzaj dokumenty na podstronie programu, na który aplikujesz.