Program kształcenia w zakresie Nauk o Ziemi i środowisku obejmuje kształcenie w zakresie:
- geografii fizycznej
- nauk geologicznych
W zakresie geografii fizycznej program kształcenia umożliwia uzyskanie stopnia doktora w zakresie geomorfologii, hydrologii, meteorologii i klimatologii, gleboznawstwa i geografii gleb oraz geografii fizycznej kompleksowej i geoekologii, a także geograficznych systemów informacyjnych.
W zakresie nauk geologicznych program kształcenia umożliwia uzyskanie stopnia doktora w zakresie mineralogii, petrologii i geochemii a także sedymentologii, paleontologii, geologii krasu, kartografii geologicznej, geologii planetarnej oraz geologii antropocenu.
Rekrutacja odbywa się osobno na geografię fizyczną i na nauki geologiczne; odrębne są limity przyjęć i sporządzane są odrębne listy rankingowe. Rekrutacja opiera się na rozmowie kwalifikacyjnej, która dotyczy zainteresowań naukowych Kandydata, merytorycznej znajomości tematyki planowanych badań oraz motywacji do podjęcia kształcenia w Szkole Doktorskiej.