W oparciu o §7 ust. 1 i 3 uchwały nr 5/I/2020 Senatu Uniwersytetu Jagiellońskiego z dnia 29 stycznia 2020 roku w sprawie: zasad rekrutacji do Szkoły Doktorskiej Nauk Ścisłych i Przyrodniczych na Uniwersytecie Jagiellońskim w roku akademickim 2020/2021, Dyrektor Szkoły Doktorskiej Nauk Ścisłych i Przyrodniczych ogłasza konkurs dla doktoranta ze stypendium finansowanym ze środków projektu badawczego na program kształcenia Biofizyka.
W ramach projektu PERUDIUM BIS zaakceptowana przez Dyrektora komisja przeprowadzi rekrutację do projektu, która będzie podstawą do przyjęcia wybranego kandydata (-tki) na program kształcenia biofizyka.
Kierownik projektu prof. dr hab. Maciej Kozak oferuje możliwość zrealizowania doktoratu w temacie:
„Badania strukturalne białek w wysokich ciśnieniach na linii SOLCRYS w Narodowym Centrum Promieniowania Synchrotronowego SOLARIS”.
Szczegółowych informacji na temat projektu udziela kierownik projektu – prof. dr hab. Maciej Kozak (ma.kozak@uj.edu.pl) lub dr inż. Joanna Sławek (joanna.slawek@uj.edu.pl).
Streszczenie projektu stanowi załącznik do niniejszego ogłoszenia.
Po odbyciu rozmów i ocenie kandydatów, przewodniczący komisji przedstawi dyrektorowi protokół wskazujący kandydata(-ów) rekomendowanego(-ych) do przyjęcia do szkoły w ramach projektu.
Harmonogram konkursu:
- Otwarcie konkursu: 26.08.2021
- Termin przesyłania aplikacji: 12.09.2021
- Egzaminy wstępne: 15-16.09.2021
- Ogłoszenie wyników: 20.09.2021
- Wpisy: 22-23.09.2021
- Wpisy (lista rezerwowa): 24-27.09.2021
Szczegółowe warunki i tryb rekrutacji znajdują się pod linkiem.
Dokumenty aplikacyjne:
- życiorys (cv)
- kopia dyplomu magisterskiego (lub równoważnego)
- zaświadczenie o średniej ocen z ukończonych studiów pierwszego stopnia oraz zaświadczenie o średniej ocen z pierwszego roku studiów drugiego stopnia (magisterskich) lub, w przypadku studiów jednolitych magisterskich, zaświadczenie o średniej ocen z wyłączeniem ostatniego roku studiów
- list motywacyjny
- kopie dokumentów potwierdzających kompetencje i osiągnięcia naukowe.
Prosimy o przesyłanie dokumentów aplikacyjnych na adres mailowy do Kierownika Projektu ma.kozak@uj.edu.pl oraz umieszczenie ich w elektronicznym systemie IRK (irk.uj.edu.pl).
Dokumenty wymagane przy wpisie na program kształcenia biofizyka:
- podpisane i wydrukowane podanie IRK o przyjęcie na program kształcenia w Szkole Doktorskiej;
- kopia: dyplom potwierdzający kwalifikacje drugiego stopnia lub inny dokument ukończenia uczelni za granicą uprawniający do podjęcia studiów trzeciego stopnia w państwie, w którym został wydany lub uznany za równoważny z odpowiednim polskim dyplomem ukończenia studiów drugiego stopnia lub jednolitych studiów magisterskich, a w przypadku, gdy w terminie rejestracji kandydat nie posiada jeszcze dokumentu tego dyplomu – wydane przez uczelnię zaświadczenie potwierdzające zdanie egzaminu dyplomowego z podanymi ocenami z egzaminu dyplomowego, z pracy dyplomowej oraz na dyplomie, zawierające informację o uprawnieniu do podjęcia studiów trzeciego stopnia w państwie, w którego systemie działa ta uczelnia (dla absolwentów studiów drugiego stopnia także zaświadczenie zawierające te oceny z ukończonych studiów pierwszego stopnia),
- kopia: suplement do dyplomu lub oficjalny transkrypt ocen, a w przypadku ich braku indeks lub inny dokument zawierający nazwy kursów oraz otrzymane oceny (którego skan został przesłany na etapie rejestracji),
- kopie innych dokumentów potwierdzających kompetencje i osiągnięcia naukowe,
- do wglądu: dokument tożsamości oraz oryginały wszystkich dokumentów przesyłanych na etapie rejestracji
W przypadku narażenia na działanie czynników szkodliwych, uciążliwych lub niebezpiecznych dla zdrowia, kandydat w momencie wpisu otrzymuje skierowanie na badania lekarskie przeprowadzane przez lekarza medycyny pracy. Kandydat jest zobowiązany do dostarczenia w wyznaczonym przez kierownika programu terminie zaświadczenia lekarskiego o braku przeciwwskazań do podjęcia kształcenia (dotyczy tylko wybranych programów kształcenia).
Dyplomy ukończenia studiów wyższych uzyskane za granicą powinny być:
- opatrzone apostille, gdy kraj wydający dokument jest objęty Konwencją znoszącą wymóg legalizacji zagranicznych dokumentów urzędowych, sporządzoną w Hadze 5 października 1961 r. (Dz. U. z 2005 r. Nr 112, poz. 938) lub
- poddane legalizacji, w pozostałych przypadkach.
Do każdego dokumentu wydanego w języku innym niż polski lub angielski kandydat jest zobowiązany załączyć poświadczone tłumaczenie na język polski lub angielski.
Ubezpieczenie:
Każdy doktorant, w tym cudzoziemiec, przyjęty do szkoły doktorskiej podlega obowiązkowo ubezpieczeniu zdrowotnemu, jeżeli nie podlega temu ubezpieczeniu z innego tytułu (np. stosunku pracy, umowy zlecenie, działalności gospodarczej, podlegania jako członek rodziny do 26. roku życia, jako współmałżonek osoby ubezpieczonej). Składkę z tytułu ubezpieczenia zdrowotnego opłaca Uniwersytet Jagielloński i jest ona finansowana z budżetu państwa. Ponadto, doktorant pobierający stypendium doktoranckie podlega obowiązkowemu ubezpieczeniu emerytalnemu i rentowemu oraz wypadkowemu.
WAŻNE:
Osoba przyjęta do szkoły doktorskiej rozpoczyna kształcenie i nabywa prawa doktoranta z chwilą złożenia ślubowania. Dział Spraw Osobowych zgłasza każdego doktoranta przyjętego do Szkoły do obowiązkowego ubezpieczenia zdrowotnego i społecznego w momencie rozpoczęcia kształcenia. Do tego czasu kandydat – cudzoziemiec zobowiązany jest pokryć indywidualnie koszty ubezpieczenia na czas podróży, leczenia, etc.
Streszczenie projektu:
Jednym z ważnych i ciągle aktualnych problemów jest zachowanie struktury makrocząsteczek biologicznych (kwasów nukleinowych czy białek) w wysokich ciśnieniach. Problem ten w szczególności dotyczy enzymów białkowych, które potencjalnie mogą mieć zastosowania w biotechnologii. W ich przypadku istotne jest zachowanie zarówno struktury czwartorzędowej (multimeru) jaki i trzeciorzędowej w warunkach ekstremalnych, w których potencjalnie zachodzić może zarówno rozpad struktur oligomerów jak i struktury przestrzennej.
Celem niniejszego projektu jest zbadanie zachowania w warunkach wysokich ciśnień wybranych białek modelowych (ksylanazy, izomerazy glukozy) zarówno w krysztale jak i w roztworze.
Izomeraza ksylozy/glukozy ze Streptomyces rubiginosus jest tetramerem zbudowanym z czterech identycznych podjednostek (homotetramer) i katalizuje odwracalną reakcję izomeryzacji cukrów prostych (ksylozy i glukozy). Kolejnym z wybranych do badań enzymów jest jednodomenowe białko - ksylanaza z Trichoderma longibrachiatum, który katalizuje reakcję przypadkowej hydrolizy wewnętrznych połączeń (-1,4-D-ksylozydowych) w ksylanie będącym głównym komponentem roślinnej hemicelulozy.
Struktury tych białek zostały już wcześniej poznane, jednak zaplanowane badania wysokociśnieniowe tych struktur są już nowością. Białka te zostaną wykrystalizowane i w oparciu o uzyskane kryształy przeprowadzone zostaną eksperymenty dyfrakcyjne w wysokich ciśnieniach (do 2 GPa) przy użyciu promieniowania synchrotronowego. Uzyskane dane dyfrakcyjne posłużą do rozwiązania i udokładnienia ich struktur krystalicznych. Równolegle do badań dyfrakcyjnych przeprowadzone zostaną analizy struktury tych białek w roztworze w wysokich ciśnieniach przy użyciu techniki małokątowego rozpraszania promieniowania synchrotronowego. Pozwoli to na zbadanie potencjalnych zmian strukturalnych ksylanazy i izomerazy glukozy zachodzących w roztworze.
Eksperymenty dyfrakcyjne i SAXS prowadzone będą zarówno na liniach pomiarowych w synchrotronach europejskich jak i w Narodowym Centrum Promieniowania Synchrotronowego „SOLARIS” w Krakowie.
Obecnie w NCPS „SOLARIS” konstruowana jest linia badawcza SOLCRYS dedykowana do badań dyfrakcyjnych białek (PX) oraz pomiarów małokątowego rozpraszania promieniowania synchrotronowego (SAXS). Na linii SOLCRYS możliwe będą również badania struktury biomakrocząsteczek w wysokich ciśnieniach. W ramach planowanych badań SAXS i PX przewidzianych w niniejszym projekcie możliwa będzie weryfikacja możliwości badawczych linii SOLCRYS.
